医院系统的洁净室用于手术室，也就是我们现在所说的医院手术室净化工程。开始它只是在矫形手术中获得广泛应用,因为矫形手术时间较长,易于引起感染。控制水平较理想的是使用手术台附近的空气洁净度达到100级。一般建议使用顶部高效空气过滤系统,它能覆盖至少3m×3m的面积,从而将手术台和人包括在内。

  医疗洁净室获得应用的其它领域有分娩室、保育室、烧伤室、心脏病人护理单元等。进展之一是牙外科手术洁净室的应用,它降低了在长期手术过程中医务人员被感染的危险。

  洁净室作为医院重要的功能分区之一，其工程质量直接影响到医院的使用和对患者的治疗。要提高医院洁净室的工程质量，必须从设计、施工和维护三方面同时重视。