药厂无尘车间控制的主要目的是为了防止因污染或交叉污染等任何危及药品质量的情况发生。目前一些药厂在进行GMP改造过程中，在空调净化系统设计方面片面追求高洁净度的问题，国内有关专家纷纷表示惋惜。其实，相对于微电子行业来说，药厂的无尘车间生产环境对洁净度的要求要低很多。

药厂无尘车间洁净区对温湿度要求较为宽松，生产工艺对温度和湿度无特殊要求时，以穿着洁净工作服不产生不舒服感为宜。空气洁净度100级、10000级区域一般控制温度为20～24℃，相对湿度为 45%-60%。100000级区域一般控制温度为18～28℃，相对湿度为50 %--65%。这个温湿度范围及精度要求相对电子厂要求较为宽松，一般来说采用集中式冷水机组+组合风柜送风可达到要求。投资较少及运行费用低。